1962 : LEKNAS-LIPI

Lembaga Ekonomi dan Kemasyarakatan Nasional – Lembaga Ilmu Pengetahuan Indonesia (LEKNAS-LIPI) berdiri pada tahun 1962, yang merupakan cikal bakal P2E-LIPI.Direktur pertama LEKNAS-LIPI  adalah Prof. Dr. Sadarjoen Siswomartojo dan Dewan Pembina yang terdiri atas Prof. Dr. Widjojo Nitisastro, Prof. Dr. Ali Wardhana, Prof. Dr. M. Sadli, Prof. Dr. Emil Salim, Prof. Sarbini Somawinata,Prof. Kuntjaraningrat , Dr. M. Makagiansar.
Direktur I     : Prof. Dr. Sadarjoen Siswomartojo
Direktur II    : Prof. Dr. Wijoyo Nitisastro
Direktur III  : Prof. Dr. Harsya W. Bachtiar
Direktur IV  : Prof. Dr. Taufik Abdullah
Direktur V   : Dr. Suharso

 

1986 : PEP-LIPI

LEKNAS LIPI reorganisasi menjadi Pusat     Penelitian Pengembangan Ekonomi dan Pembangunan (PEP-LIPI). 
Kepala PEP-LIPI:
Dr. Thee Kian Wie (1986-1990)
Drs. Ahmad Hamid (1990-1997)
Prof. Dr. Carunia Mulya Firdausy (1997-2001)

 

2001:  P2E

Berdasarkan surat Keputusan Presiden No 178/2000 pada tanggal 15 desember 2000 tentang reorganisasi LIPI dan surat Keputusan Kepala LIPI No 1151/M/2001 pada 5 Juni 2001 tentang reorganisasi dan tata kerja LIPI, PEP-LIPI berubah menjadi Pusat Penelitian Ekonomi (P2E) LIPI. P2E-LIPI berada di bawah Kedeputian Ilmu Sosial dan Kemanusiaan-LIPI.
Kepala P2E-LIPI:
Drs. Mahmud Thoha, MA (2001 - 1 Juli 2009)
Drs. Darwin, M.Sc. (1 Juli 2009 -7 Juli 2015)

Dr Agus Eko Nugroho (7 Juli 2015- saat ini)